به گزارش کیهان ،بسیج اساتید، بسیج دانشجویی، بسیج کارکنان و انجمن اسلامی مستقل دانشگاه تربیت مدرس در نامه‌ای سرگشاده به محمد فرهادی وزیر علوم، تحقیقات و فناوری اعلام کردند: در بدو پذیرش مسئولیت خطیر وزارت علوم، تحقیقات و فناوری تاکید موکد داشتید، ایجاد فضای آرام و با نشاط علمی در دانشگاه‌ها و ترسیم فتنه88 به عنوان «خط قرمز» از مهمترین مواردی است که دانشگاهیان باید بر آن اجماع داشته باشند.
در ابتدای این نامه آمده است: جنابعالی همچنین در روز اخذ رای اعتماد از مجلس شورای اسلامی بر این نکته به درستی تاکید کردید که «تشکل‌ها در چارچوب ضوابط شکل می‌گیرند و مدیریت شده فعالیت می‌کنند و نشریات نیز باید در مسیر انقلاب و علم باشند» و افزودید: «باور عمیق من این است که برای تحقق این برنامه‌ها باید از مدیرانی بهره‌گیری کرد که علاوه بر تدین و ایمان از تخصص و توانایی نیز برخوردار باشند و تحقق این برنامه‌ها را فراتر از مسائل حزبی و جناحی بدانند». با این وجود مدتی است برخی جریانات سیاسی خارج از دانشگاه با مصادره به مطلوب ارزش‌هایی نظیر ضرورت ایجاد جامعه چندصدایی و به استناد آیین‌نامه تشکل‌های اسلامی و سیاسی دانشگاهیان مصوب شورای عالی انقلاب فرهنگی و با تفسیر به رای ناصواب قوانین، اقدام به ساماندهی اقداماتی حاشیه‌ساز در سطح دانشگاه‌های کشور می‌کنند. این نامه ادامه می‌دهد: توجه به اهمیت اولویت‌ها در مسیر رشد و تعالی کشور از یک سو و جایگاه دانشگاه تربیت مدرس به عنوان درهًْ‌التاج دانشگاه‌های کشور از سوی دیگر، می‌طلبد این دانشگاه تولید نظریات علمی برای تعمیق الگوی اسلامی – ایرانی پیشرفت را به عنوان راهبردی‌ترین نیاز کشور در دستور کار خود قرار داده و بیش از این در این راه سستی به خرج ندهد. مع الاسف تاسیس تشکل‌های فرمایشی برای فعالیت‌های احساسی و دلالت آن‌ها به سوی حرکت‌های ساختارشکنانه نافی این نیاز ضروری کشور است و اصرار بر این موضع می‌تواند زمینه‌های افول علمی و پژوهشی دانشگاه‌ها و مراکز آموزش عالی کشور را در پی داشته باشد.
در پایان این نامه مجموعه بسیج(اساتید- دانشجویان- کارکنان) و انجمن اسلامی دانشجویان مستقل دانشگاه تربیت مدرس اعلام کردند که انتظار دارند تا مسئولان ذیربط در وزارت علوم و دانشگاه‌ها نگاهی فراجناحی به فعالیت تشکل‌های دانشجویی و گستره فعالیت‌های آنها داشته باشند و با مد نظر قرار دادن رهنمودهای مقام معظم رهبری مبنی بر ضرورت جلوگیری «مدیران دانشگاه‌ها از تبدیل مراکز علمی به محل جولان و فعالیت‌های جریان‌های سیاسی که متأسفانه در دوره‌ای شاهد این پدیده زیان بار بودیم»؛ و نیز در این دوره با حمایت جریانهای خاص سیاسی حاضر در فتنه 88 و مقابله کنندگان با قوانین و مقررات جاری کشور؛ خواهیم بود، در تصمیم‌گیری‌های خود پیرامون تاسیس تشکل‌های اسلامی و به کارگیری اعضای هیئت علمی متعهد، با معیارهایی همچون پایبندی به ارزش‌های اصیل انقلاب اسلامی، اعتقاد نظری و عملی به ولایت مطلقه فقیه، حفظ و حراست از کیان انقلاب اسلامی و رعایت خطوط قرمز نظام نیز توجه ویژه داشته باشند.