برای نخستین بار در تاریخ صدا و سیمای جمهوری اسلامی ایران است که در یک برنامه  تلویزیونی به بهانه شاد بودن، برخی فرصت پیدا می‌کنند، با بیان الفاظ و عبارات و کنایه‌های  غیراخلاقی مردم را بخندانند.
شوخی‌های نامتعارف خارج از عرف در خندوانه اعتراض بسیاری از اصحاب قلم و رسانه را برانگیخته است.
 برنامه خندوانه با هدف ارائه طنز پاک و لحظات مفرح سالم برای مخاطبان تولید می‌شود ولی با توجه به محتوای اخیر این برنامه به نظر می‌رسد دچار انحراف از اهداف اولیه خود شده است. انحرافی که دقت نظر بیشتر مدیر شبکه نسیم و تهیه‌کننده این برنامه را می‌طلبد تا با چاره‌اندیشی مناسب مانع از تبدیل  این برنامه به یک آسیب فرهنگی شوند.