به عنوان خبرنگار سفر15روزه‌ای را به لبنان و اردن انجام داد و گزارش تحليلي جامعي از وضع نابسامان مسلمانان آنجا ارائه کرد. اوايل سال 1359 به عضويت سپاه درآمد و در واحد اطلاعات مشغول خدمت شد. در اين واحد بود كه نام مستعار «حسن باقري» برايش انتخاب شد.   در ديماه 1359 به عنوان يكي از معاونان ستاد عمليات جنوب انتخاب شد و در شكست محاصره سوسنگرد، فرماندهي عمليات  امام مهدي (عج) را برعهده داشت .در فتح ارتفاعات الله اكبر و دهلاويه نقش بسيار ارزنده و مهمي ايفا کرد.  در جبهه بنام « سقاي بسيجيان»  معروف بود. آنان را خيلي دوست داشت. در وراي شخصيت نظامي، روحي لطيف داشت كه سرشار از مهر و عطوفت و از خود گذشتگي بود. شهيد باقري ميقاتش را در جبهه‌ها يافته بود. از اين روي، ماندن در جبهه را به رفتن سفر حج در سال 1361 ترجيح داد. روز 9 بهمن 1361، روز ميعاد بود و شناسايي ضيافتي براي يك ملاقات جاودانه. پنج روز دور ماندن از جبهه‌ها ـ حتي اگر براي زيارت كعبه باشد ـ شايد براي شهيد باقري زياد بود!