آیت‌الله اعرافی به مناسبت حوادث اخیر و بیماری کرونا با صدور بیانیه‌ای از آمادگی حوزه‌های علمیه، طلاب و روحانیت برای کمک به مسئولان و مردم، تا ریشه‌کنی این ویروس از جامعه خبر داد و گفت که حوزویان  مشتاقانه خود را برای هرخدمت ممکن در زمینه مبارزه با کرونا و نیز سیل و زلزله اخیر،‌ به مردم شریف و مسئولان محترم اعلام می‌نمایند و از هیچ اقدامی در کمک و امداد معنوی و مادی دریغ نمی‌ورزند.
در این بیانیه آمده است: حادثه ناگوار انتشار ویروس کرونا مایه رنج و مصیبت جمعی از مردم شریف قم و هموطنان عزیز گشت و همه ملت بزرگ ایران و بزرگان حوزه و مراجع عظام و شورای عالی و مدیریت حوزه را نگران ساخت.
در این بیانیه ضمن اعلام همدردی مراجع عظام و اساتید و طلاب و فضلا و مدیریت حوزه‌های علمیه و همه نهادهای حوزه‌ای با داغدیدگان و مصیبت‌زدگان و رنج‌کشیدگان و آرزوی علو درجات برای جانباختگان و شفای عاجل برای بیماران افزوده شده است: وظیفه همگان حرکت براساس تعالیم حیات‌بخش اسلام ورهنمودهای مراجع عظام و توجه به اصول سلامت و بهداشت و کارشناسی معتبر نهادهای مسئول بهداشت و درمان و رعایت توصیه‌های بهداشت فردی و اجتماعی است و روحانیت و حوزه‌های علمیه همواره بر عنایت و اهتمام و کاربست توصیه‌های علمی و کارشناسانه و بهره‌گیری از همه تجارب و دستاوردهای علمی و ایمانی تأکید ورزیده‌اند و دراین راه پیشگام بوده‌اند و در این دوره نیزهمه نهادهای حوزه درهمه زمینه‌ها از جمله در قلمرو مراودات بین‌المللی و مسافرت‌های طلاب عزیز غیر ایرانی و در مسائل اخیر کاملاً مقررات و احتیاطات را رعایت کرده‌اند.
در این بیانیه آمده است: آشکار است که نباید از سوء استفاده دشمنان کشور و بدخواهان  کشورها و ملت‌های مستقل از هربهانه‌ای برای هجوم به فرهنگ و تخریب اقتصاد کشورها و مستضعفان جهان و تضعیف گفتمان انقلاب اسلامی و ارزش‌های دینی، غفلت ورزید و باید هوشمندانه آن را دربرنامه‌ها مدنظر قرار داد، دستگاه‌ها و اختاپوس‌های تبلیغاتی غرب مشکلات خود را کوچک و مشکلات دیگران را برای تضعیف فرهنگ و اقتصاد آنان بزرگ نشان می‌دهند.
در این بیانیه بیان شده است: مدیران محترم حوزه‌ها و مدارس و مراکز و نهادهای حوزوی در استان‌ها لازم است با بهره‌گیری از اختیارات تفویض شده، نهایت ابتکار و تلاش خود را بکار گیرند تا روند علمی و آموزشی و تبلیغی حوزه آسیب نبیند و از همه فناوری‌ها و فضای مجازی باید بهره‌ گیرند و با رعایت نظرات کارشناسان و مسئولان استان و نهادهای همسو برای یاری‌رسانی به آسیب‌دیدگان از سیل اخیر و کرونا و پاسخ به نیازهای فرهنگی و روانی و معنوی جامعه و مردم عزیز در این ماه شریف، برنامه‌ریزی و اقدام نمایند و البته جریان علمی حوزه باید همچنان بانشاط و سرزنده استمرار یابد و توقف و تعطیل آن باید به حداقل برسد.
در این بیانیه آمده است: حوزه و روحانیت همواره بر سر ارادت و عهد و پیمان خود با مردم عزیز و شریف ایران و قم ایستاده است و خواهد ایستاد و فداکاری و ایثار در راه سعادت و سلامت و آرامش آنان را وظیفه خود می‌داند؛ حوزه قم و حوزه‌های سراسر کشور و جهان ‌و همه مراکز و نهادهای حوزه، این پیوند ناگسستنی را افتخار خود می‌دانند و اکنون نیز حوزه و نهادهای آن و یکایک حوزویان و بویژه طلاب و اساتید و فضلای جوان حوزه و تشکل‌های حوزویان در قم و سراسر کشور آمادگی مشتاقانه خود را برای هرخدمت ممکن در زمینه مبارزه با کرونا و نیز  سیل و زلزله اخیر،‌ به مردم شریف و مسئولان محترم اعلام می‌نمایند و از هیچ اقدامی در کمک و امداد معنوی و مادی دریغ نمی‌ورزند و به فضل الهی این جریان استمرار دارد و اکنون نیز با هماهنگی مسئولان ذی‌ربط امداد در اشکال گوناگون آغاز شده است.
در این بیانیه آمده است: در پایان از همه مسئولان و مردمی که در مهار این آسیب و سایر حوادث طبیعی تلاش می‌نمایند و بویژه از پزشکان ارجمند و پرستاران عزیز و همه دست‌اندرکاران سلامت جامعه، که در خط مقدم این جبهه ایثار می‌نمایند، تقدیر و تشکر می‌نمایم‌.