وی از آذر ماه ۱۳۵۸ تا ۱۳۷۵ به جرم جاسوسی در زندان بود. دادگاه انقلاب اسلامی عباس امیرانتظام معاون نخست‌وزیر و سخنگوی دولت موقت و سفیر سابق ایران در کشورهای اسکاندیناوی را برای جرائم: شرکت در توطئه انحلال مجلس خبرگان در مقابله با ولایت فقیه، تعهد در تفریق بین مسلمین و جدا کردن برادران انقلابی فلسطین و لیبی از حمایت نهضت اسلامی ایران، فراری دادن سران رژیم فاسد گذشته و ماموران سیاسی سفارت رژیم شاه در اسرائیل و مقامات عالیرتبه مجلس سنای طاغوت و سرمایه‌داران صهیونیست تحت تعقیب، انجام ملاقات‌ها و تماس‌های سرّی و دادن اطلاعات و آگاهی به دشمنان انقلاب و نهضت اسلامی در باره مسائل و مشکلات داخلی و اوضاع سیاسی کشور مجرم شناخته و او را به حبس ابد محکوم کرده بود.
در سال‌های گذشته برخی مدعیان اصلاحات در جهت بزک کردن چهره امیرانتظام دست به انتشار یادداشت‌ها و مصاحبه‌هایی زده‌اند که مرور مواضع این افراد در طول دهه شصت نشان از ریاکاری آنان دارد.
رئیس‌دولت اصلاحات که به دنبال فوت امیرانتظام پیام تسلیتی صادر کرده است 18 مهر 1360 خطاب به مهندس بازرگان دبیرکل وقت نهضت آزادی ضمن حمله به امیرانتظام نوشته بود : « چه نقصی در کار شما است که فردی چون امیرانتظام جاسوس و مزدور آمریکا تا سطح معاونت نخست‌وزیر و سخنگوی دولت موقت بالا می‌آید؟!»
مصطفی تاجزاده محکوم فتنه و از اعضای سازمان مجاهدین انقلاب اسلامی که چندی پیش از ظلم به امیرانتظام سخن گفته بود در 27 اردیبهشت 1360 به همراه دیگر دوستان خود طی بیانیه‌ای به ادعاها مبنی بر نادرست بودن اسناد جاسوسی امیرانتظام واکنش نشان داده و نوشته بود : « به راستی اگر اسناد جعلی است، پس اصرار بر اینکه ترجمه این اسناد مغرضانه است و ناشیانه یعنی چه؟ و اگر ساخته دست آمریکائیان است و از روی نقشه صورت گرفته پس ادعای اینکه این‌ها استنباطات شخصی جاسوسان بوده است و يا آنکه آنها به فارسی تسلط نداشته اند، چه معنی می‌دهد؟»
سازمان مجاهدین انقلاب اسلامی در پایان این بیانیه خطر وابستگان به غرب را مورد تاکید قرار داده و از دادگاه انقلاب اسلامی خواسته است که تحت تاثیر جوسازی‌ها واقع نشده و با قاطعیت عمل کند تاخدشه‌ای به خط راستین امام وارد نیاید.
معادیخواه نماینده وقت مجلس نیز که بعدها طی نامه‌ای از امیرانتظام عذرخواهی کرده بود اردیبهشت 1360 با حضور در جلسه محاکمه امیرانتظام گفته بود : « امیرانتظام یکی از عوامل نفوذ خط آمریکا در انقلاب اسلامی ایران است.» وی همچنین 7 خرداد 1360 طی سخنانی گفته بود : « ساکت نشستن در برابر اسناد جاسوسی امیرانتظام مثل سکوت در مقابل شاه و جنایت‌های گذشته آمریکا است.»
بی شک مواضع امروز مدعیان اصلاحات را می‌توان به نزدیکی نظری آنان به چهره‌های مجذوب آمریکا است که پس از انقلاب به اتهام جاسوسی محاکمه و محکوم شدند، آنان به اسناد جدیدی دست نیافته‌اند بلکه جبهه‌ها و مواضع دو دسته به هم نزدیک شده و در یک نقطه یعنی بزک کردن شیطان بزرگ به هم رسیده است.