متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرّحمن الرّحیم
درگذشت تأسف‌انگیز عالم بزرگوار حجت‌الاسلام والمسلمین آقای حاج سیّدعلیرضا حائری را به بازماندگان و خاندان مکرّم و ارادتمندان و همکاران علمی ایشان در مؤسسه‌ دائرهًْ‌المعارف فقه که اخیراً به ریاست آن منصوب شده بودند، تسلیت عرض می‌کنم.
خدمات علمی و تبلیغی این عالم فرزانه ذخیره ماندگاری برای خود آن مرحوم و یادگار ارزنده‌ای برای علاقه‌مندان و راه‌جویان و مایه رحمت و مغفرت الهی است ان‌شاءالله.
از خداوند متعال علوّ درجات و حشر با اجداد طاهرینشان را برای ایشان مسألت می‌کنم. والسلام علیکم
سیّدعلی خامنه‌ای
۲۸ تیرماه ۱۳۹۸