متن پیام تسلیت رهبر معظم انقلاب اسلامی به شرح زیر است:
بسم‌الله‌الرحمن‌الرحیم
با اندوه و تأسف خبر درگذشت روحانی مبارز و پارسا و مردمی، رفیق صمیمی و قدیمی جناب حجت‌الاسلام آقای حاج شیخ عباس پورمحمدی رفسنجانی را دریافت کردم. زندگی سراسر تلاش و خدمت همراه با اخلاص و سلامت نفس و بی‌اعتنائی به جلوه‌ها و زخارف مادی، خصوصیت برجسته‌ این روحانی کم‌نظیر در همه‌ دوران‌های حیات او است. در دوران اختناق طاغوتی، با شجاعت و صراحت، پرچم نام و راه امام راحل را بر دوش داشت و در دوران نظام مقدس جمهوری اسلامی، پیشرو خدمات‌رسانی به محرومان و اقدام‌های فرهنگی و اجتماعی در گستره‌ای وسیع بود. در همه‌ دوران‌‌ها هرگز از مردم و به خصوص طبقات محروم جدا نشد و هرگز جز راه خدا نپیمود. رحمت و غفران الهی شامل حال او باد.
به خاندان مکرم، همسر گرامی و فرزندان و دیگر بازماندگان و همه‌ دوستداران و آشنایان ایشان صمیمانه تسلیت عرض می‌کنم.
سید علی خامنه‌ای
۲۵ آبان ۱۳۹۵   
کیهان: درگذشت این عالم وارسته و انقلابی را به حوزه‌های علمیه، بازماندگان و مخصوصا به فرزند آن مرحوم، جناب آقای علی‌اصغر پورمحمدی تسلیت عرض می‌کنیم.