حجت‌الاسلام محمدموحد دادستان ویژه روحانیت تهران در گفت‌وگو با تسنیم، اظهار داشت: در پی اظهارات آقای یونسی که در روزنامه‌ها و رسانه‌ها نیز پخش شد، گزارش‌های مختلفی از سوی دادستانی عمومی تهران و مراجع امنیتی ارجاع شد.
وی ادامه داد: با توجه به وصول این گزارش‌ها، آقای یونسی به دادسرای ویژه روحانیت احضار شدند، تحقیقات لازم انجام و اظهارات ایشان استماع شد.
موحد با بیان اینکه قرار تأمین برای وی صادر شده است گفت: اما هنوز پرونده به دادگاه ارجاع نشده است و بعد از طی فرآیند لازم ارسال می‌شود.
رئیس دادگاه انقلاب، اتهام یونسی را اظهارات خلاف امنیت ملی عنوان کرد.
گفتنی است روز گذشته معاون دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقلیت‌ها در اظهاراتی خلاف واقع خبر احضار حجت‌الاسلام یونسی به دادگاه ویژه روحانیت را تکذیب کرده بود.
سعید زارع در گفت‌وگو با ایلنا در واکنش به انتشار خبری مبنی بر احضار حجت‌الاسلام یونسی به دادگاه ویژه روحانیت گفت: چنین خبری صحت ندارد و دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقلیت‌ها به مراجع قضایی احضار نشده است.
معاون دستیار ویژه رئیس‌جمهور در امور اقلیت‌ها و مسئول روابط عمومی و ارتباطات دفتر دستیار ویژه رئیس‌جمهور انتشار چنین اخباری را ادامه فشار به دولت خوانده و گفته بود: برخی گروه‌ها به دنبال حاشیه‌سازی برای دولت هستند و می‌خواهند در روند کاری دولت اخلال ایجاد کنند.
وی، رسانه‌ها را به رعایت اخلاق توصیه کرده و گفته بود: کار صحیح و حرفه‌ای نیست که برخی رسانه‌ها اخبار خود را بدون منبع و تنها برای حاشیه‌سازی منتشر کنند.
گفتنی است علی یونسی در آخرین اظهارنظر خود با تأکید بر پیوند قومی و مذهبی ایران با بسیاری از کشورهای منطقه گفته است: ایران بر تمامیت ارضی و استقلال کشورهای خاورمیانه تأکید دارد.
به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی ریاست‌جمهوری، حجت‌الاسلام علی یونسی در دیدار نوروزی با نمایندگان اقلیت‌های دینی در مجلس شورای اسلامی، با اشاره به برداشت‌های اخیر برخی رسانه‌ها از سخنانش اظهار داشت: آنچه گفتم حرف جدیدی نبود. ملت ایران در طول تاریخ با ملت‌های همسایه خود پیوند قومی و فرهنگی داشته است. ملت و جمهوری اسلامی ایران از اتفاقاتی مانند آنچه برای ایزدی‌ها و سایر اقوام و اقلیت‌های مذهبی و دینی در عراق و سوریه رخ داد، متاثر شد.
وی در امور اقوام و اقلیتهای دینی و مذهبی افزود: جمهوری اسلامی ایران به عنوان کشوری مقتدر خود را دوست و حامی کشورها و مردم منطقه خاورمیانه می‌داند و همواره بر تمامیت ارضی و استقلال آن کشورها تاکید می‌کند.
دستیار ویژه رئیس‌جمهور در ادامه بیان کرد: برخی جریانات سیاسی سخنم را به گونه دیگری منعکس کردند به طوری که رسانه‌های خارجی که ضد جمهوری اسلامی ایران هستند و از نفوذ  معنوی ایران در منطقه خاورمیانه ناراحتند، سخنانم را تحریف کردند و به فضاسازی رسانه‌ای پرداختند.
نمایندگان اقلیت‌‌های دینی در مجلس شورای اسلامی نیز در این دیدار برای پیگیری مسائل اقلیت‌های دینی، خواستار توجه و کمک بیشتر دولت در حوزه اجرایی و همچنین رفع مشکلات حقوقی اقلیت‌های دینی شدند.