در قسمت‌هایی از این نامه آمده است:
قطعا امروز شخصی پیدا نمی‌شود که از اهمیت و میزان اثرگذاری دانشگاه و مراکز آموزش عالی در کشور آگاه نباشد و نداند که اگر دانشگاه‌های کشور محلی برای علم‌اندوزی و تولید علوم مورد نیاز کشور باشند، آنگاه این تمامی ملت ایران هستند که از برکات این اتفاق مبارک بهره‌مند خواهند شد و فرآیند تولید علم در دانشگاه‌ها منجر خواهد شد به استفاده صنایع از این علوم و در نهایت پیشرفت، توسعه و آبادانی ایران اسلامی و اگر دانشگاه‌ها از این هدف مطلوب خارج گردند و به هر هدف حتی بعضا مستحب دیگر مشغول گردند، عواقب این رخداد چیزی نخواهد بود الا عقب‌ماندگی کشور در رقابت پرشتاب علمی در جهان و دراز کردن دست در برابر سایر ملت‌ها برای استفاده از علوم و صنایع تولید شده براساس این علوم در آن کشورها.
شاید امروز هیچ شخصی به اندازه رهبر معظم انقلاب (دامت برکاته) به اهمیت نقش علم و پژوهش در کشور اهتمام نورزیده و برای پیشرفت کشور در این عرصه دغدغه نداشته است.
این دغدغه از تاکیدهای فراوان ایشان بر لزوم استقلال علمی کشور، دست یافتن به قلل رفیع علم و دانش و از همه مهمتر ایجاد روحیه در دانشگاه‌ها و دانشجوها و اعتقاد راسخ به مفهوم «ما می‌توانیم» به وضوح روشن و مبرهن است.
این روزها در ایامی قرار داریم که مردم غیور ایران در 9 دی‌ماه بساط فتنه و فتنه‌گرانی را برچیدند که قصد داشتند از دانشگاه به عنوان ابزاری برای پیشبرد اهداف شوم خود بهره‌برداری کنند که اتفاقا دانشجویان و اساتید انقلابی هم سهمی عظیم در این حماسه ایفا کردند.
فلذا ما اعلام می‌کنیم که وزارت علوم جمهوری اسلامی و دانشگاه‌های در طراز آن، می‌بایست مدیرانی را در راس خود ببینند که نه تنها سوابق منفی در فتنه علیه ملت ایران نداشتند، بلکه اتفاقا ندای این عمار رهبری را لبیک گفته باشند و به روشنگری و دفاع از انقلاب اسلامی در دانشگاه‌ها پرداخته باشند.
در این راستا اتحادیه انجمن‌های اسلامی دانشجویان مستقل دانشگاه‌های سراسر کشور بر خود لازم می‌داند از اقدام شایسته، انقلابی و علمی حضرتعالی در برکناری افرادی که صلاحیت کافی برای خدمت در مناصب بالای وزارتخانه مهمی همچون وزارت علوم را نداشتند تشکر کرده و برای جنابعالی و سایر همکاران متدین و انقلابی‌تان آرزوی سلامتی و توفیق روزافزون برای خدمت به نظام اسلامی و جامعه بزرگ دانشگاهیان از درگاه ایزد منان می‌نماید.