زیباکلام علت حضور خود در دادگاه را اینگونه عنوان کرد: سؤالات بازپرسی در مورد اظهاراتم در خصوص قوه قضائیه و برخی اظهارنظرهایم (مسائل کارشناسی و تخصصی در حوزه‌های حساس کشور) است.
وی که به دلیل اظهارات خلاف واقعش در دادگاه بدوی به یک سال و نیم حبس محکوم شده است، همچنین اظهار داشت: برای پیگیری از وضعیت پرونده‌ام و درخواست دادگاه تجدیدنظر به دادگاه انقلاب آمده‌ام.
زیباکلام، در ادامه اظهارات قابل تامل خود، پس از خروج از دادگاه انقلاب گفت: بنده هنوز فتنه 88 را نمی‌فهمم؛ هنوز نفهمیدم که این فتنه چه بوده است؟ عده‌ای که به سه میلیون نفر می‌رسند به نتیجه انتخابات اعتراض می‌کنند که معمولا این اتفاق در کشورهای دیگر هم می‌افتد. اگر مقصود از فتنه این باشد که آمریکا، انگلیس و آلمان و یا از ما بهتران تبانی کرده بودند که در داخل نظام ایران به کمک عده‌ای آن را براندازی کنند، باید بگویم چنین چیزی نبوده است!
وی افزود: چطور می‌شود که میلیون‌ها انسان که رای دادند بعد از 48 یا 72 ساعت بخواهند به براندازی نظام بپردازند، نه چنین چیزی امکان ندارد!
این اظهارات زیباکلام در حالی صورت می‌پذیرد که بسیاری از سران جریان‌های همسو با آقای زیباکلام نیز، فتنه 88 را حرکتی از قبل طراحی شده برای براندازی نظام جمهوری اسلامی برشمرده‌اند.
زیباکلام همچنین در صحبت‌های عجیب دیگری پس از خروج از دادگاهش راجع به پرونده ‌هاشمی هم اظهارنظر کرده و گفته است: اگر شرط‌بندی حلال بود شرط می‌بستم که اتهامات مهدی ‌هاشمی سیاسی است و اتهامات اقتصادی آن را قبول ندارم!
مدرس علوم سیاسی دانشگاه تهران، همچنین با ادعای اینکه تنها به جرم پرسیدن دو سؤال برایم یک سال و 6 ماه حبس بریده‌اند، گفت: سؤال اولم از آقای شریعتمداری بوده و پرسیده‌ام که مسئله هسته‌ای چه سودی برای مملکت داشت و به جرم این سؤال یک سال حبس برایم بریده‌اند !
وی سؤال دوم خود را هم اینگونه بیان کرده است: سؤال کردم که متهمین اختلاس سه هزار میلیاردی دقیقا چه جرمی مرتکب شده بودند که شما آنها را محکوم به اعدام کردید؟ این سؤال از سوی دادگاه مصداق توهین به قوه قضائیه محسوب شد و به 6 ماه حبس محکوم شدم !
این اظهارات خلاف واقع زیباکلام در حالی صورت می‌پذیرد که خود وی پیش از این گفته بود که مدیرمسئول روزنامه کیهان از وی شکایتی نکرده و احضار وی به دادگاه ارتباطی به این موضوع ندارد. بدیهی است که یک سال و 6 ماه حبس نمی‌تواند صرفاً به دلیل پرسیدن دو سؤال بوده باشد.
گفتنی است، دادستان عمومی و انقلاب تهران به عنوان مدعی‌العموم از صادق زیباکلام با عناوین اتهامی تبلیغ علیه نظام، تشویش اذهان عمومی، توهین به قوه قضائیه، افترا و تضعیف نظام در بهمن ماه سال گذشته شکایت کرده بود. وی پس از حضور در شعبه 12 بازپرسی فرهنگ و رسانه برای پاسخگویی به این عناوین اتهامی، با قرار وثیقه 50 میلیون تومانی آزاد شد. پرونده وی پس از تکمیل در بازپرسی به شعبه 36 دادگاه انقلاب رفت و اکنون در این شعبه در جریان است.