مهدی پناهی با اشاره به گذشت 6 ماه از شهادت شهید علی خلیلی با وجود اینکه پیکر وی در گلزار شهدا به خاک سپرده شده است، اما هنوز شهادت ایشان در بنیاد شهید و امور ایثارگران به ثبت نرسیده است.
وی تاکید کرد: از همان ابتدا پی‌گیر وضعیت پرونده احراز شهادت علی خلیلی بودیم زیرا مسئولین بنیاد شهید احراز شهادت را منوط به تشکیل کمیسیون 135 در سپاه پاسداران با حضور نمایندگانی از سپاه و بنیاد کرده بودند.
پناهی در گفت‌وگو با تسنیم افزود: مدارک مربوط به پرونده شهید خلیلی از جمله نظر نهایی  پزشکی قانونی و حکم ماموریت شهید برای امر به معروف و نهی از منکر تکمیل است و نمایندگان سپاه نیز با استناد به این مدارک خواستار احراز شهادت شده‌اند، اما بنیاد شهید و امور ایثارگران به 2 بند از پرونده اشکال وارد کرد به طوری که کمیسیون به نتیجه نرسید.
وی افزود: بنیاد شهید احراز شهادت را منوط به وجود کارت ضابط در پرونده دانسته است و حال آنکه شهید علی خلیلی حکم ماموریت به همراه داشت و زیر این‌گونه حکم‌ها نیز عبارت «دارنده این حکم ضابط قضایی محسوب می‌شود» نوشته شده است.
گفتنی است طلبه 19 ساله شهید علی خلیلی حدود 3 سال پیش در 25 تیر ماه سال 90 به خاطر امر به معروف و نهی از منکر مورد حمله اشرار قرار گرفت و شاهرگ گردنش به شدت آسیب دید. بیش از 2 سال و نیم درد و رنج این مجروحیت را تحمل کرد و از بیمارستانی به یبمارستان دیگر تحت معالجه پزشکان قرار گرفت. اما نهایتا روز سوم فروردین 1393 درد ناشی از این مجروحیت او را از پای درآورد و به شهادت رسید. پناهی گفت: مراحل درمان شهید علی خلیلی تا روز شهادت بیش از 100 میلیون تومان هزینه دربر داشته است.