مرحوم طباطبایی، مدتی با بیماری کلیوی دست و پنجه نرم می‌کرد و سرانجام، صبح روز چهارشنبه ۱۶ مردادماه در ۵۹ سالگی بر اثر ایست قلبی در بیمارستان طالقانی تهران درگذشت.
حدود چهار سال پیش نیز فرزند این تهیه‌کننده نیز که به بازیگری ‌اشتغال داشت، درگذشته بود.
تهیه‌کنندگی سریال‌هایی چون «قلب یخی»، «کاکتوس»، «بچه‌های نسبتا بد» و «شب عید» و فیلم‌هایی چون «مرد آفتابی»، «عزیزم من کوک نیستم»، «سالاد فصل»، «شب»، «فرار بزرگ»، «هر شب تنهایی»، «توفیق اجباری» و... در کارنامه سیدکمال طباطبایی دیده می‌شود.