شهید آیت‌اللهی‌طباطبائی از نواده‌های مرحوم آخوند ملااسماعیل عقدائی (از علمای یزد) و از خانواده‌ای روحانی بود. او در سال 1301 در روستای مزرعه‌آخوند از توابع استان یزد متولد شد. بعد از تحصیلات ابتدایی به اصفهان عزیمت کرد. بعد از ادامه تحصیلات به قم عزیمت نمود و از محضر اساتید قم و همچنین حضرت آیت‌الله بروجردی درک فیض نمود. بعد از مدتی به نجف‌اشرف برای ادامه دروس اجتهاد مشرف شد و بعد از هشت سال دوباره به تهران بازگشت و امامت مسجد خرقانی را عهده‌دار شد و مسجد فوق را تجدید بنا نمود.قبل از انقلاب راهپیمایی‌های عظیم مردمی را از محل سکونت خود رهبری می‌کرد تا اینکه از طرف حکومت نظامی وقت دستگیر و زندانی شد. همزمان با پیروزی ملت ایران به رهبری حضرت آیت‌الله العظمی امام خمینی آزاد و با ایجاد کمیته مساجد، کمیته مسجد خرقانی را اداره می‌کرد و از جان و مال و ناموس مردم محافظت می‌نمود.حجت‌الاسلام آیت‌اللهی از ارادتمندان خاص خاندان نبوت به خصوص حضرت اباعبدالله الحسین(ع) بودند به طوری که منزل سابق مسکونی خود را وقف نمودند تا عوائد آن خرج مراسم عزاداری و اطعام گردد. همچنین در زمان حیات از سال 1333 همه ساله مراسم عزاداری و اطعام را خود برپا می‌داشتند و مردم را هدایت می‌نمودند تا اینکه در هشتمین روز شهریور ماه سال 1360 بعد از اقامه نماز صبح، هنگام خارج شدن از منزل به دست منافقین از خدا بی‌خبر ترور و همان طوری که شهادت آرزویش بود و در نماز شب از خدا می‌خواست که در بستر فوت نکند، همانند جدش صورت و عمامه‌اش به خونش آغشته گشت و به شهادت رسید.