این مرکز با زیربنای 200متر مربع شامل اتاقهای اسکن، کنترل، پزشک، ریکاوری و آنژیوگرافی است.
برای راه اندازی این مرکز 2میلیارد ریال و برای خرید دستگاه سی تی آنژیوگرافی 70میلیارد ریال هزینه شده که 50 درصد آن خیری است. امکان تصویربرداری دقیق از تمام عروق بدن به وسیله عروق کرونر قلب درحداقل زمان (تنها در چند ثانیه) و با حداقل اشعه امکانپذیر از مزایای این دستگاه است.
با بهره‌برداری از این مرکز،ضرورت انجام آنژیوگرافی تهاجمی وخطرات مربوط به آن مرتفع شده به طوری که در بسیاری از بیماران با اطلاعات به دست آمده از سی تی آنژیوگرافی دیگر نیازی به آنژیوگرافی نیست.
وضوح وکیفیت تصاویر بدست آمده دستگاه جدید، بسیار بالا بوده و امکان بازسازی سه بعدی شبیه سازی مشابه آنچه به صورت واقعی در بدن وجود دارد میسر می‌شود.استفاده از این روش، به ویژه درمورد کودکان و نوجوانان که سرعت تصویر برداری وکیفیت بالای تصاویر همراه با حداقل میزان اشعه موردنیازاست به عنوان بهترین مدلیته تصویر برداری از قلب و عروق مطرح است. بیمارستان افشار یزد در سال 1357 ساخته شده و دارای بخش‌های مختلف پزشکی است.
بهره‌برداری از نخستین مرکز خیرساز آموزش و مهارت آموزی پدافند غیر عامل کشور و شرکت در کنگره شهدای عرصه پزشکی از دیگر برنامه‌های سفر یکروزه وزیر بهداشت به استان یزد بود.
14 بیمارستان دولتی در استان یزد زیر نظر دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی است و در مجموع 132 مرکز بهداشتی درمانی شهری در استان یزد وجود دارد.