مراسم تشییع آیت‌الله محمدی گیلانی صبح پنجشنبه از مدرسه عالی شهید مطهری با حضور رئیس دفتر رهبر معظم انقلاب، دبیر شورای نگهبان و جمع کثیری از مقامات لشکری و کشوری به سمت سرچشمه برگزار شد.
در این مراسم حجت‌الاسلام سید حسن خمینی تولیت حرم مطهر امام خمینی(ره) بر پیکر آیت‌الله محمدی گیلانی نماز اقامه کرد.
شایان ذکر است مراسم بزرگداشت آن مرحوم، روز شنبه 21 تیرماه از ساعت 30/10 تا 30/12 در مسجد ارک تهران برپا خواهد شد.
به گزارش خبرنگار کیهان از قم پیکر آیت‌الله محمد محمدی گیلانی عصر پنجشنبه از مسجد امام‌حسن عسکری تا حرم مطهر حضرت معصومه(س) تشییع و در مسجد بالا سر حرم مطهر به خاک سپرده شد. در این مراسم که جمع کثیری از مردم و روحانیان و نیز آیات عظام مدرسی یزدی، مصباح‌ یزدی، عباس محفوظی، حسن ممدوحی، صادق خرازی و همچنین رئیس مجلس شورای اسلامی حضور داشتند، آیت‌الله سبحانی بر پیکر مرحوم آیت‌الله محمد محمدی گیلانی نماز اقامه کرد.
مراسم بزرگداشت آن مرحوم پنجشنبه شب در مسجد اعظم قم برگزار شد.
 در این مراسم آیت‌الله سبحانی، آیت‌الله هاشمی شاهرودی عضو هیئت رئیسه مجلس خبرگان رهبری، آیت‌الله حسینی بوشهری مدیر حوزه‌های علمیه، آیت‌الله مقتدایی نایب رئیس جامعه مدرسین حضور داشتند.
حجت‌الاسلام‌والمسلمین آشتیانی معاون جامعه مدرسین حوزه علمیه قم در این مراسم به بیان گوشه‌ای از شخصیت مرحوم آیت‌الله محمدی گیلانی پرداخت و خدمات وی در عرصه‌های مختلف نظام اسلامی را تشریح کرد.
وی با اشاره به اینکه آیت‌الله محمدی گیلانی را می‌توان از افراد راسخ و ثابت‌قدم در راه انقلاب دانست، تصریح کرد: در طول دوره‌های مختلف و فراز و نشیب‌ها هیچ تغییری در خط مشی ایشان ایجاد نشد.
معاون جامعه مدرسین حوزه علمیه قم با اشاره به اینکه از آیت‌الله محمدی گیلانی آثاری ارزشمند به یادگار مانده است، اظهار داشت: ایشان در مسائل دینی و فقهی با قلم و نوشتار خود در مسیر یاری کردن دین تلاش کردند.